1．验收调查工作可分为准备、初步调查、编制实施方案、详细调查、编制调查报告五个阶段。
　　(1)准备阶段：收集、分析工程有关的文件和资料，了解工程概况和项目建设区域的基本生态特征，明确环境影响评价文件和环境影响评价审批文件有关要求，制定初步调查工作方案。
　　(2)初步调查阶段：核查工程设计、建设变更情况及环境敏感目标变化情况，初步掌握环境影响评价文件和环境影响评价审批文件要求的环境保护措施落实情况、与主体工程配套的污染防治设施完成及运行情况和生态保护措施执行情况，获取相应的影像资料。
　　(3)编制实施方案阶段：确定验收调查标准、范围、重点及采用的技术方法，编制验收调查实施方案文本。
　　(4)详细调查阶段：调查工程建设期和运行期造成的实际环境影响，详细核查环境影响评价文件及初步设计文件提出的环境保护措施落实情况、运行情况、有效性和环境影响评价审批文件有关要求的执行情况。
　　(5)编制调查报告阶段：对项目建设造成的实际环境影响、环境保护措施的落实情况进行论证分析，针对尚未达到环境保护验收要求的各类环境保护问题，提出整改与补救措施，明确验收调查结论，编制验收调查报告文本。
　　2．调查结论主要包括：
　　(1)总结建设项目对环境影响评价文件及环境影响评价审批文件要求的落实情况。
　　(2)重点概括说明工程建成后产生的主要环境问题及现有环境保护措施的有效性，在此基础上，对环境保护措施提出改进措施和建议。
　　(3)根据调查和分析的结果，客观、明确地从技术角度论证工程是否符合建设项目竣工环境保护验收条件，主要包括：
　　①建议通过竣工环境保护验收。
　　②限期整改后，建议通过竣工环境保护验收。
　　3．清洁生产调查主要调查环境影响评价文件和批复文件所要求的清洁生产指标落实情况，如：
　　(1)单位产品耗新鲜水量及废水回用率；
　　(2)固体废物资源化利用率；
　　(3)单位产品能耗指标及清洁能源替代要求；
　　(4)单位产品污染物产生量指标等。